В основе сюжета «Аннигиляции» — борьба с некой неизученной болезнью, превращающей людей в живых мертвецов. Теряясь в непроглядном хаосе города, как в потемках души, герои пытаются выживать. Сквозь тревогу, страх и ощущение бессилия они, словно тени самих себя, строят отношения, совершают привычные действия, стараясь поддерживать иллюзию нормал...